Вычисления расстояний (scipy.spatial.distance)

Справочник функций

Вычисление матрицы расстояний из набора векторов исходных наблюдений, хранящихся в прямоугольном массиве.

pdist(X[, metric, out])	Попарные расстояния между наблюдениями в n-мерном пространстве.
cdist(XA, XB[, metric, out])	Вычисление расстояния между каждой парой двух наборов входных данных.
squareform(X[, force, checks])	Преобразует вектор расстояний в квадратную матрицу расстояний и наоборот.
directed_hausdorff(u, v[, rng, seed])	Вычислить направленное расстояние Хаусдорфа между двумя двумерными массивами.

Предикаты для проверки корректности матриц расстояний, как сжатых, так и избыточных. Также в этом модуле содержатся функции для вычисления количества наблюдений в матрице расстояний.

is_valid_dm(D[, tol, throw, name, warning])	Возвращает True, если входной массив является корректной матрицей расстояний.
is_valid_y(y[, warning, throw, name])	Возвращает True, если входной массив является допустимой сжатой матрицей расстояний.
num_obs_dm(d)	Возвращает количество исходных наблюдений, соответствующих квадратной, избыточной матрице расстояний.
num_obs_y(Y)	Вернуть количество исходных наблюдений, соответствующих сжатой матрице расстояний.

Функции расстояния между двумя числовыми векторами u и v. Вычисление расстояний по большой коллекции векторов неэффективно для этих функций. Используйте pdist для этой цели.

braycurtis(u, v[, w])	Вычислить расстояние Брея-Кёртиса между двумя 1-D массивами.
canberra(u, v[, w])	Вычислить расстояние Канберры между двумя одномерными массивами.
chebyshev(u, v[, w])	Вычислить расстояние Чебышёва.
cityblock(u, v[, w])	Вычислить расстояние Манхэттена (City Block).
correlation(u, v[, w, centered])	Вычислить корреляционное расстояние между двумя одномерными массивами.
cosine(u, v[, w])	Вычислить косинусное расстояние между одномерными массивами.
euclidean(u, v[, w])	Вычисляет евклидово расстояние между двумя одномерными массивами.
jensenshannon(p, q[, base, axis, keepdims])	Вычислите расстояние (метрику) Йенсена-Шеннона между двумя вероятностными массивами.
mahalanobis(u, v, VI)	Вычислить расстояние Махаланобиса между двумя одномерными массивами.
minkowski(u, v[, p, w])	Вычисление расстояния Минковского между двумя одномерными массивами.
seuclidean(u, v, V)	Возвращает стандартизированное евклидово расстояние между двумя одномерными массивами.
sqeuclidean(u, v[, w])	Вычислить квадрат евклидова расстояния между двумя одномерными массивами.

Функции расстояния между двумя булевыми векторами (представляющими множества) u и v. Как и в случае числовых векторов, pdist более эффективен для вычисления расстояний между всеми парами.

dice(u, v[, w])	Вычислить несходство Дайса между двумя булевыми одномерными массивами.
hamming(u, v[, w])	Вычислить расстояние Хэмминга между двумя одномерными массивами.
jaccard(u, v[, w])	Вычисление расстояния Жаккара между двумя булевыми векторами.
kulczynski1(u, v, *[, w])	Вычислить несходство Кульчинского 1 между двумя булевыми одномерными массивами.
rogerstanimoto(u, v[, w])	Вычислить несходство Роджерса-Танимото между двумя булевыми одномерными массивами.
russellrao(u, v[, w])	Вычислить расхождение Рассела-Рао между двумя булевыми одномерными массивами.
sokalmichener(u, v[, w])	Вычисление несходства Сокала-Миченера между двумя булевыми одномерными массивами.
sokalsneath(u, v[, w])	Вычислить расстояние Сокала-Снита между двумя булевыми одномерными массивами.
yule(u, v[, w])	Вычислить несходство Юла между двумя булевыми одномерными массивами.

hamming также работает с дискретными числовыми векторами.